История создания Совета молодых ученых включает несколько этапов. Приказом Министерства образования и науки Республики Бурятия № 000 от 01.01.2001 г. был создан Совет молодых ученых и специалистов Бурятии при Министерстве образования и науки Республики Бурятия. Деятельность СМУС РБ регламентируется Положением о Совете молодых ученых и специалистов Республики Бурятия.
В 2003 году был создан Совет молодых ученых как консультативно-совещательный орган при Государственном комитете по делам молодежи, туризма, физической культуре и спорта.
В 2007 году Совет был реорганизован в Региональную общественную организацию «Совет молодых ученых Республики Бурятия».
В состав Совета входят представители Советов молодых ученых вузов республики и Совета научной молодежи БНЦ СО РАН. За период деятельности Совета создан плацдарм для консолидации молодых ученых на республиканском уровне и активизации научно-исследовательской деятельности.